2007-04-01から1ヶ月間の記事一覧

Affinity propagation

論文を漁ってたら1月のScienceに,“Clustering by Passing Messages Between Data Points”なる怪しげな(良い意味で)クラスタリング法の話を見つけた.アルゴリズム名は“Affinity propagation”.Back propagationを彷彿とさせるネーミング.まだよく理解して…

BLASTメモ

短いアミノ酸配列をBLAST検索するときはパラメータの調整が必要. Expect threshold : 20000 Word size : 2 Matrix : PAM30 Compositional adjustments : No adjustment New BLASTのサイトではこの調節が自動的になされるみたい. http://www.ncbi.nlm.nih.g…